空分耐水硅膠是由硅酸鈉與酸反應生成，二者的濃度對其骨架結構有很深的影響。當反應中可供形成粒子的原料濃度過低時，形成的粒子稀少，彼此間距離甚遠，不足以相互聯結，最多只能形成稀的溶膠；而當濃度一定大又不夠大時，粒子可能只長大卻不聯接，因此可能生成沉淀物而不是凝膠；當濃度過大時，過多粒子相互距離過近，膠凝速度過快，反應便有可能不均勻。只有適宜的濃度才能在粒子適度長大的同時進行粒子間的聯結，使得空分耐水硅膠的骨架結構穩固并具有較為均勻的孔結構，從而增強空分耐水硅膠顆粒強度，減緩吸水脫水時孔隙的表面張力對骨架的破壞。